طرح‌هاي پژوهشي پژوهشگاه در دست انجام :591 طرح پژوهشي.
برخي از مهم‌ترين طرح‌های پژوهشی پژوهشگاه در دست انجام
× دایره‌المعارف‌ها و دانش‌نامه‌ها در دست انجام
ادامه دائره المعارف قرآن کریم؛
ادامه دانشنامه قرآن کریم ویژه نوجوانان؛
ادامه دانشنامه اعلام قرآن؛
ادامه دانشنامه قرآنی اخلاق؛
ادامه دانشنامه علوم قرآنی؛
ادامه دانشنامه قرآنی معارف عقلي؛
ادامه دانشنامه اصولیان شیعه؛
ادامه دانشنامه قرآنی فقه و اصول؛
ادامه دانشنامه حج و حرمين؛
دانشنامه اهل‌بیت(علیهم‌السلام)؛
دانشنامه سبک زندگی براساس آموزه‌های قرآن و اهل‌بیت(علیهم السلام).
× اصطلاح‌نامه‌ها در دست انجام
اصطلاح‌نامه راویان حدیث؛
اصطلاح‌نامه حقوق جزای اختصاصی؛
اصطلاح‌نامه حقوق جزای عمومی؛
اصطلاح‌نامه مسائل جدید کلامی؛
اصطلاح‌نامه فقه؛
اصطلاح‌نامه ادیان.
× فرهنگ‌نامه‌ها در دست انجام
ادامه فرهنگ‌نامه تحلیل واژگان مشابه در قرآن کريم؛
ادامه فرهنگ‌نامه تحلیلی وجوه و نظائر در قرآن کريم؛
فرهنگ‌نامه کلام اسلامی؛
فرهنگ‌نامه منطق.
کلان پروژه ها در دست انجام:
ادامه سیاست متعالیه از منظر حکمت متعالیه؛
ادامه اندیشه‌نامه متفکران مسلمان؛
ادامه دانش سیاسی در ایران معاصر؛
ادامه فلسفه فقه سیاسی؛
ادامه فقه نظام سیاسی؛
ادامه سیاست در قرآن کریم؛
ادامه موسوعه روایات سیاسی؛
ادامه فلسفه سیاسی مشا ؛
ادامه فلسفه علم سیاست؛
ادامه اخلاق و سیاست؛
ادامه فقه روابط بین‌الملل و سیاست خارجی؛
ادامه امنيت در اسلام؛
ادامه روحانیت و سیاست؛
ادامه فلسفۀ زبان و علم اصول؛
ادامه رابطة نفس و بدن؛
ادامه توانايىهاى فلسفۀ اسلامى و ربط و نسبت آن با حيات سياسىـ اجتماعى؛
ادامه عقل و دین؛
ادامه اندیشه‌نامه متکلمان امامیه؛
ادامه الهيات اخلاق؛
ادامه مباني روانشناختي تربيت اخلاقي-ديني؛
ادامه منتقد المنافع فی شرح مختصر النافع؛
ادامه مدل‌های نواندیشی، روشنفکری و احیاگری دینی؛
ادامه پارادایم مکتب‌های عرفانی شیعه؛
ادامه اخلاق کاربردی؛
ادامه نقد معنویت‌های کاذب؛
ادامه تبیین ابعاد معنویت اسلامی؛
ادامه مطالعات نظام سازی قرآنی؛
مرجعیت علمی قرآن؛
قرآن و استشراق؛
نقد انگاره‌های ناهماهنگی قرآن و علوم تجربی
فقه هنر؛
اخلاق دين داري؛
اخلاق مديريت؛
اخلاق زيستي.